Lorsque près de 100 personnes ont regardé un flux en direct sur YouTube le 2 avril, on pouvait leur pardonner de penser qu’elles avaient assisté à une version virtuelle d’un dîner-théâtre de l’époque médiévale. Chaque avatar dans le dôme gris qu’est l’environnement logiciel Nanome portait des lunettes de couleur et une chemise de couleur. Les cinq avatars, chacun contrôlé par un scientifique, étaient là pour combattre le SRAS-CoV-2 ou Coronavirus en réalité virtuelle (RV).

Exploration du Coronavirus en VR
Exploration du Coronavirus en VR

Cependant, plutôt que des lances et des épées, ils portaient des armes moléculaires. 

L’événement en direct a été organisé par SynBioBeta, et les avatars étaient représentés :

  • Steve McCloskey, fondateur et PDG de Nanome (équipe turquoise).
  • Rob Rhinehart, associé chez Mars Bio et directeur de l’initiative Corona (équipe rouge).
  • Robert Scoble, gourou de la VR (équipe jaune).
  • Philip Rosedale, fondateur de Second Life (équipe violette).
  • John Cumbers, fondateur de SynBioBeta (équipe noire).

John Cumbers a souhaité la bienvenue aux téléspectateurs avant de placer deux molécules contenant des atomes gris, blancs, bleus, rouges et verts devant le groupe.

McCloskey, ingénieur et fondateur de Nanome, a expliqué que les couleurs des atomes correspondent aux éléments colorés du tableau périodique à l’intérieur du logiciel Nanome : les carbones sont gris, les azotes bleus, les hydrogènes blancs, et les atomes de chlore verts.

« Si vous savez ce que sont ces molécules, tapez la réponse dans le chatbox », a expliqué M. Cumbers à l’auditoire. 

Quelques minutes plus tard, M. McCloskey a attribué aux spectateurs des points virtuels pour avoir correctement identifié les deux premières molécules comme étant la chloroquine et l’hydroxychloroquine. Il a expliqué qu’il s’agit de deux petites molécules actuellement utilisées pour traiter certaines maladies du système immunitaire (autrefois utilisées pour traiter la malaria) et certaines maladies auto-immunes, et qu’elles ont été autorisées pour un usage d’urgence pour traiter COVID-19, la maladie causée par le nouveau coronavirus, le SRAS-CoV-2. Toutefois, l’efficacité du traitement de cette maladie n’a pas encore été démontrée par des études.

Selon M. McCloskey, il n’y a pas de consensus au sein de la communauté scientifique sur la manière dont ces médicaments agissent au niveau moléculaire.

« Ohe théorie est que le pH est affecté, ce qui à son tour affecte la glycosylation du récepteur ACE2 et l’affinité de liaison du domaine de liaison du récepteur de la protéine de pic viral (RBD) », a déclaré Rob Rhinehart, partenaire chez Mars Bio et directeur de l’Initiative Corona. Le récepteur de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2), qui est présent sur de nombreux types de cellules humaines, est la protéine à laquelle le SARS-CoV-2 s’attache pour pénétrer dans les cellules humaines.

En examinant la structure de cette protéine et des protéines virales, les chercheurs espèrent trouver des domaines que les fabricants de médicaments pourraient cibler pour vaincre la pandémie qui sévit dans le monde.

« La « -ase » de la protéase signifie couper », a déclaré Mme Rhinehart. « Cette protéine est responsable de la génération des protéines individuelles qui forment de nouvelles particules virales. » Rhinehart a pris le contrôle et a chargé un médicament à petite molécule fabriqué par Gilead Sciences, le remdesivir. Il a montré comment il s’insère dans la poche à l’intérieur de la protéase. « Nous pouvons voir comment cela pourrait être très efficace en tant que thérapeutique en perturbant la fonction de la protéase », a-t-il dit. « Mais nous ne le savons pas. Le Remdesivir a en fait été conçu pour cibler l’ARN polymérase virale, pas la protéase. »

McCloskey a montré aux autres une molécule qu’il avait lui-même conçue pour cibler la protéase et qu’il a soumise à un concours de conception de médicaments très fréquenté, puis il a pointé du doigt 27 acides aminés de l’ECA2 qui entrent en contact avec la protéine de pointe du virus ; le reste de l’ECA2 a disparu. « Il y a un groupe au MIT qui produit cette chaîne peptidique », a-t-il déclaré. « L’idée est d’empêcher le virus de se lier aux cellules humaines en bloquant la RBD. »

La plupart des structures avec lesquelles le groupe a travaillé pendant le flux de vie sont accessibles au public et peuvent être visualisées gratuitement dans le logiciel Nanome. 

« Le rythme de résolution des problèmes et de collaboration que permet la RV est sans précédent », a déclaré M. Cumbers. « La RV devient un outil utile dans le domaine scientifique, et en raison de la manière dont elle est utilisée au milieu de la crise COVID-19, son adoption généralisée sera probablement accélérée ». 

« C’est l’avenir », a convenu Robert Scoble, qui est un gourou de la RV.


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Publié par Al

Abdelghafour Lammamri, 26 ans, Rédacteur Web, passionné par le monde des technologies (les smartphones et la réalité virtuelle/augmentée).

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